Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms