Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms