Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NESP48681 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NESP48681 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NESP48681 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms