Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP8P40818 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP8P40818 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP8P40818 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms