Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL9P32969 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL9P32969 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL9P32969 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL9P32969 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL9P32969 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL9P32969 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL9P32969 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms