Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms