Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISM1B1AKI9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms