Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXD3Q9UJU5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXD3Q9UJU5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXD3Q9UJU5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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