Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDHAF3Q9NRP4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms