Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM27Q9HBJ8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms