Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms