Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM4Q9C037 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM4Q9C037 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms