Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF4Q9BZC1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF4Q9BZC1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms