Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-6Q9BXR3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms