Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PRPF18Q99633 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PRPF18Q99633 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PRPF18Q99633 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PRPF18Q99633 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRPF18Q99633 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRPF18Q99633 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRPF18Q99633 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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