Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RNFT2Q96EX2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNFT2Q96EX2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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