Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms