Protein–RNA interactions for Protein: Q95460

MR1, Major histocompatibility complex class I-related gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MR1Q95460 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MR1Q95460 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms