Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPDL3BQ92485 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms