Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C11orf40Q8WZ69 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms