Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FAM78BQ5VT40 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FAM78BQ5VT40 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM78BQ5VT40 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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