Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF2Q5BJF6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF2Q5BJF6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms