Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD12Q587J7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms