Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASPRV1Q53RT3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms