Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ZNF56Q15929 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms