Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNHIT3Q15649 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms