Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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