Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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CUL4AQ13619 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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