Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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