Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3B2Q13367 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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