Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMF1P82094 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMF1P82094 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms