Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms