Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms