Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ME1P48163 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ME1P48163 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ME1P48163 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ME1P48163 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ME1P48163 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms