Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSFMP43897 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms