Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL1P40616 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL1P40616 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms