Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CMPK1P30085 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms