Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCEA1P23193 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms