Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC10Q9NYD6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC10Q9NYD6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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