Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG1

PRTFDC1, Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTFDC1Q9NRG1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRTFDC1Q9NRG1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms