Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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