Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms