Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ULK4Q96C45 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms