Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAVIN3Q969G5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms