Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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