Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf43Q8TAL5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf43Q8TAL5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf43Q8TAL5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf43Q8TAL5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf43Q8TAL5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf43Q8TAL5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf43Q8TAL5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms