Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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