Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms