Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRPF8Q6P2Q9 CS-215ENST00000549143 2811 ntTSL 26.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 27.7
PRPF8Q6P2Q9 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 27.7
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PRPF8Q6P2Q9 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 27.7
PRPF8Q6P2Q9 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 27.7
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PRPF8Q6P2Q9 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 27.7
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PRPF8Q6P2Q9 AKAP10-202ENST00000395536 1815 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 27.7
PRPF8Q6P2Q9 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.41e-8■■■■■ 27.7
PRPF8Q6P2Q9 GART-218ENST00000497313 457 ntTSL 36.55□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 27.7
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PRPF8Q6P2Q9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.126e-11■■■■■ 27.7
PRPF8Q6P2Q9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.126e-11■■■■■ 27.7
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