Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM164Q5U3C3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms